Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MsmbO08540 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MsmbO08540 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MsmbO08540 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MsmbO08540 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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MsmbO08540 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
MsmbO08540 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MsmbO08540 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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