Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms