Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim18J3QNP2 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms