Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc180J3QNE4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc180J3QNE4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms