Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Top6blJ3QMY9 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Top6blJ3QMY9 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Top6blJ3QMY9 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Top6blJ3QMY9 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Top6blJ3QMY9 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Top6blJ3QMY9 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Top6blJ3QMY9 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Top6blJ3QMY9 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Top6blJ3QMY9 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Top6blJ3QMY9 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Top6blJ3QMY9 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Top6blJ3QMY9 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Top6blJ3QMY9 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Top6blJ3QMY9 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms