Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm11236J3QMS7 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gm11236J3QMS7 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gm11236J3QMS7 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gm11236J3QMS7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gm11236J3QMS7 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gm11236J3QMS7 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm11236J3QMS7 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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