Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
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