Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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