Protein–RNA interactions for Protein: F6VWU8

Zfp946, Zinc finger protein 946, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp946F6VWU8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Zfp946F6VWU8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Zfp946F6VWU8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Zfp946F6VWU8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Zfp946F6VWU8 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Zfp946F6VWU8 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Zfp946F6VWU8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Zfp946F6VWU8 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Zfp946F6VWU8 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Zfp946F6VWU8 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp946F6VWU8 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms