Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn5F6UCX4 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms