Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms