Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

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Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Myo5cE9Q1F5 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms