Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

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Length 1,068 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Krt78E9Q0F0 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Krt78E9Q0F0 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Krt78E9Q0F0 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Krt78E9Q0F0 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt78E9Q0F0 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Krt78E9Q0F0 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt78E9Q0F0 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt78E9Q0F0 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Krt78E9Q0F0 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Krt78E9Q0F0 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Krt78E9Q0F0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Krt78E9Q0F0 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt78E9Q0F0 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt78E9Q0F0 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt78E9Q0F0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt78E9Q0F0 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt78E9Q0F0 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt78E9Q0F0 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Krt78E9Q0F0 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt78E9Q0F0 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt78E9Q0F0 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt78E9Q0F0 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt78E9Q0F0 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Krt78E9Q0F0 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt78E9Q0F0 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt78E9Q0F0 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Krt78E9Q0F0 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt78E9Q0F0 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt78E9Q0F0 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt78E9Q0F0 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt78E9Q0F0 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt78E9Q0F0 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt78E9Q0F0 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt78E9Q0F0 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt78E9Q0F0 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt78E9Q0F0 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt78E9Q0F0 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt78E9Q0F0 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt78E9Q0F0 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt78E9Q0F0 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt78E9Q0F0 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt78E9Q0F0 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt78E9Q0F0 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt78E9Q0F0 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt78E9Q0F0 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt78E9Q0F0 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt78E9Q0F0 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt78E9Q0F0 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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