Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms