Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms