Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms