Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms