Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syce3B5KM66 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms