Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf11cB4XVP9 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Phf11cB4XVP9 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf11cB4XVP9 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf11cB4XVP9 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf11cB4XVP9 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf11cB4XVP9 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf11cB4XVP9 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf11cB4XVP9 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf11cB4XVP9 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf11cB4XVP9 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
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