Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms