Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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