Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprsB0V2N1 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms