Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Tmem238A9JSM3 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms