Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms