Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rnf39A2RT81 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf39A2RT81 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms