Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms