Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ckap5A2AGT5 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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