Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms