Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms