Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Hdac6Q9Z2V5 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Hdac6Q9Z2V5 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Hdac6Q9Z2V5 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Hdac6Q9Z2V5 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Hdac6Q9Z2V5 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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Hdac6Q9Z2V5 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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