Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms