Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms