Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms