Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Uso1Q9Z1Z0 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms