Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Clip2Q9Z0H8 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Clip2Q9Z0H8 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Clip2Q9Z0H8 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Clip2Q9Z0H8 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Clip2Q9Z0H8 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Clip2Q9Z0H8 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Clip2Q9Z0H8 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Clip2Q9Z0H8 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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