Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q6

Arpc1a, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1A, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc1aQ9R0Q6 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arpc1aQ9R0Q6 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arpc1aQ9R0Q6 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arpc1aQ9R0Q6 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Arpc1aQ9R0Q6 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arpc1aQ9R0Q6 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arpc1aQ9R0Q6 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Arpc1aQ9R0Q6 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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Arpc1aQ9R0Q6 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Arpc1aQ9R0Q6 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arpc1aQ9R0Q6 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Arpc1aQ9R0Q6 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arpc1aQ9R0Q6 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arpc1aQ9R0Q6 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arpc1aQ9R0Q6 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arpc1aQ9R0Q6 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arpc1aQ9R0Q6 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arpc1aQ9R0Q6 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arpc1aQ9R0Q6 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Arpc1aQ9R0Q6 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arpc1aQ9R0Q6 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arpc1aQ9R0Q6 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arpc1aQ9R0Q6 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arpc1aQ9R0Q6 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Arpc1aQ9R0Q6 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arpc1aQ9R0Q6 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arpc1aQ9R0Q6 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arpc1aQ9R0Q6 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arpc1aQ9R0Q6 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Arpc1aQ9R0Q6 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arpc1aQ9R0Q6 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Arpc1aQ9R0Q6 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arpc1aQ9R0Q6 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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Arpc1aQ9R0Q6 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Arpc1aQ9R0Q6 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Arpc1aQ9R0Q6 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arpc1aQ9R0Q6 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arpc1aQ9R0Q6 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arpc1aQ9R0Q6 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Arpc1aQ9R0Q6 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arpc1aQ9R0Q6 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Arpc1aQ9R0Q6 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Arpc1aQ9R0Q6 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arpc1aQ9R0Q6 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arpc1aQ9R0Q6 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arpc1aQ9R0Q6 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arpc1aQ9R0Q6 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arpc1aQ9R0Q6 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arpc1aQ9R0Q6 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arpc1aQ9R0Q6 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arpc1aQ9R0Q6 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arpc1aQ9R0Q6 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arpc1aQ9R0Q6 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arpc1aQ9R0Q6 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arpc1aQ9R0Q6 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arpc1aQ9R0Q6 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arpc1aQ9R0Q6 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arpc1aQ9R0Q6 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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