Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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