Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsjQ9R014 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms