Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms