Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Phtf1Q9QZ09 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms