Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nphp1Q9QY53 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms