Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Kcnip3Q9QXT8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Kcnip3Q9QXT8 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Kcnip3Q9QXT8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Kcnip3Q9QXT8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Kcnip3Q9QXT8 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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