Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms