Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Dkk3Q9QUN9 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Dkk3Q9QUN9 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Dkk3Q9QUN9 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms