Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crlf1Q9JM58 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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