Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tgm1Q9JLF6 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm1Q9JLF6 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms