Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg3Q9JL95 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms