Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancaQ9JL70 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FancaQ9JL70 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FancaQ9JL70 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FancaQ9JL70 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FancaQ9JL70 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FancaQ9JL70 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FancaQ9JL70 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FancaQ9JL70 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FancaQ9JL70 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FancaQ9JL70 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FancaQ9JL70 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FancaQ9JL70 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FancaQ9JL70 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FancaQ9JL70 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FancaQ9JL70 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FancaQ9JL70 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FancaQ9JL70 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FancaQ9JL70 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FancaQ9JL70 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FancaQ9JL70 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FancaQ9JL70 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FancaQ9JL70 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FancaQ9JL70 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FancaQ9JL70 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FancaQ9JL70 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FancaQ9JL70 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FancaQ9JL70 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FancaQ9JL70 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FancaQ9JL70 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FancaQ9JL70 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FancaQ9JL70 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FancaQ9JL70 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FancaQ9JL70 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FancaQ9JL70 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FancaQ9JL70 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FancaQ9JL70 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FancaQ9JL70 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FancaQ9JL70 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
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FancaQ9JL70 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
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FancaQ9JL70 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FancaQ9JL70 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FancaQ9JL70 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
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FancaQ9JL70 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FancaQ9JL70 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FancaQ9JL70 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FancaQ9JL70 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FancaQ9JL70 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FancaQ9JL70 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FancaQ9JL70 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FancaQ9JL70 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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FancaQ9JL70 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FancaQ9JL70 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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FancaQ9JL70 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FancaQ9JL70 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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FancaQ9JL70 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FancaQ9JL70 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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FancaQ9JL70 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FancaQ9JL70 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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FancaQ9JL70 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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FancaQ9JL70 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FancaQ9JL70 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FancaQ9JL70 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FancaQ9JL70 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FancaQ9JL70 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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FancaQ9JL70 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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FancaQ9JL70 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FancaQ9JL70 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FancaQ9JL70 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FancaQ9JL70 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FancaQ9JL70 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FancaQ9JL70 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FancaQ9JL70 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FancaQ9JL70 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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FancaQ9JL70 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FancaQ9JL70 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FancaQ9JL70 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FancaQ9JL70 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FancaQ9JL70 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FancaQ9JL70 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FancaQ9JL70 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms