Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms