Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ybx3Q9JKB3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms